یک گروه مستقل از محققان گودزیلا را به عنوان یک شهاب سنگ غول پیکر کشف می‌کنند. این صخره مرموز، با آشکار شدن نیات واقعی خود، شروع به حرکت به سوی جهان و گودزیلا می‌کند.

در این قسمت مسئولین شهر سعی دارند از جانوری که تحت شعاع یک بحران هسته‌ای قرار گرفته را برای کشتن گودزیلا استفاده کنند...

در میان ویرانگری های گودزیلا، اینبار "موثرا" از راه می رسد تا نسل بشر را نجات دهد...